浪潮发布生命科学一体机 基因研究也能“一键式”

浪潮 发表于:14年10月30日 00:23 [来稿] 存储在线

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[导读]为加速我国基因科学研究的进程,浪潮于日前正式推出生命科学一体机。这一产品的问世,将使国内生命科学研究机构能够获得低成本、高效率的基因分析处理平台,更有效的开发和利用我国丰富的基因资源,加速我国基因战略的发展。

为加速我国基因科学研究的进程,浪潮于日前正式推出生命科学一体机。这一产品的问世,将使国内生命科学研究机构能够获得低成本、高效率的基因分析处理平台,更有效的开发和利用我国丰富的基因资源,加速我国基因战略的发展。

浪潮生命科学一体机

基因成为21世纪宝贵战略资源

21世纪是众所公认的生命科学的世纪,基因已经成为一种宝贵的战略资源和财富,是未来国际间竞争的焦点。而在基因研究领域,由生命科学和计算机科学相结合形成的生物信息学,已经成为揭示大量复杂生物数据潜藏奥秘的支撑性学科之一,其发展关乎基因研究的速度和成果。

数据处理难题制约基因研究

目前,基因测序技术呈现快速发展的势头,第二代测序技术可以一次完成数万至数百万条DNA分子的序列测定,使得科学家在极短时间内对人类基因组进行细致研究成为可能。不过,这也改变了原本基因研究中“测序没有处理快”的局面,大量的测序数据得不到及时处理,严重影响了基因研究进程和成果涌现。造成这一瓶颈的原因,其中既有数据处理平台计算力和计算效率不足的因素,更重要的在于基因测序软件使用门槛较高。

浪潮高性能计算总经理刘军表示,每种测序技术对应的生物信息学的分析方法存在或多或少的差异,而每种分析方法都有特定的流程,会涉及到7-8种分析软件。一方面,软件种类的复杂导致部署繁琐、周期延长、管理困难;另一方面,较高的专业性也导致无计算机或生物信息学基础的人员很难胜任数据分析工作。这些问题大大限制了数据分析的速度,制约着生物信息学科的发展以及应用。因此,开发一种易操作的生物信息学分析的软硬一体化平台,已经成为加快基因数据分析速度,更好推动我国基因战略发展的当务之急。

浪潮生命科学一体机“一键式”提升基因研究效率

据介绍,浪潮生命科学一体机的生物信息平台后台由浪潮服务器支撑,集成了基本的生物信息学工具,如Bowtie、Bwa等二代测序的比对工具, Fastqc等数据预处理工具等,能够进行全基因组重测序等二代测序的数据分析。完善的软件组合使得用户可以根据实际研发需求,自定义数据处理流程并实现一键式运行,在大幅降低部署、优化时间的同时,也通过“傻瓜式”操作降低了使用门槛。此外,浏览器登陆访问功能,使得操作人员不再受工作地点的限制,实现移动办公。

据介绍,浪潮生命科学一体机将持续收集基因数据,丰富测序比对和数据处理工具,为基因研究的用户提供便利,并致力于成为我国基因研究的重要平台型装备,为我国在该领域取得领先优势提供更好的支撑。

[责任编辑:孙莹莹]
淅西
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